الإدارة العامة للإشراف التربوي إحدى الإدارات التنفيذية بوكالة الجامعة لشؤون المعاهد العلمية ، وتعنى بمنسوبي المعاهد العلمية شاغلي الوظائف التعليمية وشؤونهم العلمية والتربوية والفنية ، والعمل في الإدارة بحكم تخصصها وطبيعة مسؤولياتها التربوية والصلاحيات الممنوحة لها عمل إشراف وتوجيه ومتابعة مستمرة .
وتعود نشأة الإدارة إلى عام 1374هـ حين ظهرت الحاجة إلى إدارة لتسيير عمل المعاهد العلمية بعد التوسع في افتتاحها ، حيث أنشئت الإدارة العامة للكليات والمعاهد العلمية التي ضمت في تشكيلها إدارة التفتيش الفني التي عنيت بالشؤون التعليمية في المعاهد العلمية ، ثم تغير اسم الإدارة إلى إدارة التفتيش التربوي .
واستمرت الإدارة في ممارسة مهامها حتى صدور قرار مجلس الوزراء ذي الرقم 12 والتاريخ 7/1/1397هـ القاضي بربط المعاهد العلمية بجامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية إداريا وفنيا ، حيث تطورت مهام الإدارة من مفهوم التفتيش إلى التوجيه ، فتغير اسم الإدارة إلى إدارة التوجيه التربوي رغبةً في تطوير العمل التربوي وتوثيق الصلة بالمدرس.
ولمواكبة التطور في مفهوم الإشراف التربوي الحديث ورغبة في تطوير عمل الإدارة فقد صدرت موافقة معالي مدير الجامعة الأستاذ الدكتور سليمان بن عبدالله أبا الخيل في 5/1/1429هـ بتعديل اسم الإدارة إلى الإدارة العامة للإشراف التربوي .
وتبعا لذلك تطورت مهام الإدارة من مفهوم التوجيه التربوي إلى مفهوم الإشراف التربوي بغرض تشخيص الموقف التعليمي وتحليله وتقويمه ثم تحسينه وتطويره. كما أنشئت أقسام حديثة في الإدارة مثل قسم الإدارة التربوية ، إضافة إلى أقسام التخصصات الحديثة مثل قسم العلوم والحاسب الآلي وقسم التربية البدنية .