يسعى الكرسي لتفعيل أهدافه من خلال بناء علاقة شراكة مع عدد من المراكز المتخصصة أو المهتمة بالحوار في العالم، مثل:

1- رابطة العالم الإسلامي، مكة المكرمة.

2- مركز الملك عبد العزيز للحوار الوطني، الرياض.

3- مركز الملك فيصل للدراسات والبحوث، الرياض.

4- المنظمة الإسلامية للتربية والعلوم والثقافة-الايسيسكو. المغرب.

5- مركز الدراسات الاستشراقية، الإمارات العربية المتحدة.

6-  مركز الحوار للدراسات الاستراتيجية والبحوث، الإمارات.

7- مركز الدراسات الاستراتيجية، جامعة دمشق.

8- مركز حوار الحضارات، جامعة النيلين، السودان.

9-  مركز الحوار العربي للدراسات الاستراتيجية والحضارية والثقافية، المغرب.

10- المعهد العالمي لوحدة الأمة الإسلامية، الجامعة الإسلامية العالمية – ماليزيا.

11- منتدى حوار الحضارات العالمي، روسيا.

12- مركز الشرق العربي للدراسات الاستراتيجية والحضارية والثقافية، لندن.

13- مركز التفاهم الإسلامي المسيحي، واشنطن.

14-  كرسي اليونسكو للحوار بين أتباع الثقافات والأديان لجنوب شرق أوروبا، جامعة كارل فرانزيس، جراز، بالنمسا.

15- كرسي اليونسكو في الحوار بين الثقافات، جامعة ايفان جافاخشفيلي الحكومية، تيبليسي، جورجيا.

16- كرسي اليونسكو في التنوع الثقافي وحوار الثقافات كلية التربية، بنيقوسيا، قبرص.

17-كرسي اليونسكو في العلاقات بين الثقافات والأديان، كلية العلوم السياسية والاجتماعية، جامعة موناش، كلايتون، استراليا.

18- مؤسسة حوار الأديان الثلاثة – بريطانيا.

19- مؤسسة توني بلير لحوار الأديان – بريطانيا.

20- مؤسسة التعايش – بريطانيا.

21- البيت العربي – مدريد.

22- مؤسسة ثقافة السلام – مدريد.

23- معهد العالم العربي – باريس.

24- مؤسسة آنا ليند للحوار – باريس.

25- مركز الشرق العربي للدراسات الحضارية والاستراتيجية – لندن.

26- مركز الحوار العربي للدراسات الاستراتيجية والحضارية-المغرب.

​