بناءً على توجيه معالي مدير الجامعة بخطابه رقم 5114/1 وتاريخ 1428/7/22هـ المبنى على موافقة معالي وزير التعليم العالي فقد تمت مباشرة وكالة الجامعة للدراسات والتطوير والاعتماد الأكاديمي بهذا المسمى لأعمالها ومهامها وفق التنظيم الإداري المعتمد حينها. وفي عام 1428هـ تم تحديد الوحدات المرتبطة بالوكالة بخطاب معالي مدير الجامعة الإلحاقي رقم 5174/1 وتاريخ 1428/7/24هـ حيث كان يتبع للوكالة كل من:
• عمادة التقويم والجودة.
• عمادة شؤون أعضاء هيئة التدريس.
• عمادة شؤون المعاهد في الخارج.
• الإدارة العامة للتخطيط والميزانية والمتابعة.
• الإدارة العامة للدراسات والمعلومات.
• الإدارة العامة للعلاقات العامة.
• مركز الملك عبد الله للدراسات الإسلامية المعاصرة وحوار الحضارات.
• المركز العام للوثائق.
وسعت من خلال هذا التحول إلى ترسيخ رسالة الجامعة نحو تحقيق جودة عالية في جميع الممارسات التعليمية والبحثية والإدارية من خلال تسيير العمل وفق ما يرسم لها ويخطط من أهداف واستراتيجيات الجامعة.
وفي عام 1433هـ حيث حدث التغيير الأكثر نوعية والأعمق تركيزاً في تنفيذ المهام المناسبة، وتغير اسم الوكالة إلى وكالة الجامعة للتخطيط والتطوير والجودة، وتم على إثر ذلك تعديل الجهات التابعة لها، فشملت ما يلي:
• عمادة التقويم والجودة.
• عمادة تطوير التعليم الجامعي والتطوير الإداري.
• معهد الملك عبد الله للترجمة والتعريب.
• عمادة دراسات العمل التطوعي.
• إدارة المخاطر.
ثم صدر في عام 1445هـ الهيكل التنظيمي الجديد للجامعة ، تزامناً مع تدشين الهوية الجديدة للجامعة، وأصبحت الوكالة أكثر تركيزاً في أهدافها ومهامها، وتغير اسم الوكالة إلى (وكالة الجامعة للتطوير المؤسسي والمسؤولية المجتمعية)، وأضحت الجهات التابعة لها حتى تاريخه ما يلي:
• عمادة التطوير والجودة.
• عمادة تقنية المعلومات والتعلم الإلكتروني .
• مركز الدراسات والمعلومات .
• مركز التخطيط الإستراتيجي .
• مركز تطوير المهارات.
• مركز الوثائق والمحفوظات.
• الإدارة العامة للمسؤولية المجتمعية وخدمة المجتمع .
• الإدارة العامة لمدينة الملك عبدالله للطالبات .
• إدارة المخاطر والطوارئ واستمرارية الأعمال.
