بناء على رغبة حكومة خادم الحرمين الشريفين في خدمة
أبناء المسلمين ورغبة حكومة جمهورية جيبوتي، وبمبادرة من جامعة الإمام محمد بن سعود
الإسلامية تم إنشاء المعهد الإسلامي في جيبوتي عام ١٤٠١هـ / ۱۹۸۱م، وطوال مسيرة المعهد
لم تتوقف عملية التطوير والتوسع فيما يقدمه من خدمات جليلة للمجتمع الجيبوتي حيث يقدم
المعهد حاليا برامجه العلمية المرحلة البكالوريوس في تخصصات الشريعة واللغة العربية،
والعلوم الإدارية والمالية، بالإضافة إلى قسم التعليم العام للمرحلتين المتوسطة والثانوية
للطلاب والطالبات.
