يُعد قسم التاريخ والحضارة من أقدم الأقسام العلمية بجامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية حيث بدأت مسيرة القسم في العام الجامعي 1389- 1390هـ، وكان يتبع قسم الاجتماعيات بكلية اللغة العربية، التي غير اسمها إلى كلية اللغة العربية والعلوم الاجتماعية وكان هذا القسم آنذاك يشتمل على تخصصين هما: التاريخ والجغرافيا، وفي عام 1393-1394هــ، تم فصل التخصصين إلى قسمين.

وفي يوم الخميس الموافق 12 ذي القعدة 1393هـ، عقد مجلس قسم التاريخ أول اجتماع له برئاسة الأستاذ الدكتور مصطفى محمد مسعد - رحمه الله- ووافق المجلس على الخطة الدراسية المعدلة للمرحلة الجامعية. 

وفي عام 1396هـ استقلت أقسام العلوم الاجتماعية بكلية قائمة بذاتها سميت باسم كلية الدراسات الاجتماعية وجعل نواتها قسمي التاريخ والجغرافيا ثم عدل أسمها بعد ذلك إلى كلية العلوم الاجتماعية.

وفي عام 1399-1400هـ، أُنشئ في قسم التاريخ شعبة الحضارة الإسلامية تبدأ الدراسة فيها في السنة الثالثة على نظام السنوات، وتركز هذه الشعبة على مواد حضارية لها علاقة بالتاريخ بالإضافة إلى مواد مساعدة أخرى. وقد تخرج من هذه الشعبة مجموعة من الطلبة المؤهلين لخدمة دينهم ووطنهم.