تُولي جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية اهتمامًا بالغًا بتعزيز البحث العلمي البيني، من خلال توفير بيئة بحثية متكاملة تُشجّع على التعاون بين الباحثين من مختلف التخصصات. وتحرص الجامعة على تجهيز مرافق بحثية متطورة مدعومة بأحدث التقنيات، بما يدعم تنفيذ أبحاث نوعية ذات أثر علمي ومجتمعي. وتسهم هذه المنظومة المتكاملة في إنتاج معرفة رصينة تستجيب لاحتياجات المجتمع، وتتماشى مع التوجهات البحثية المعاصرة. وتشمل هذه المرافق على سبيل المثال لا الحصر:
| الرقم | المرافق | المجال |
| 1. | مركز بحوث العلوم الشرعية | الرابط
|
| 2. | مركز بحوث علوم اللغة العربية | الرابط
|
| 3. | مركز بحوث العلوم الإنسانية والاجتماعية | الرابط
|
| 4. | مركز بحوث التأسيس والتاريخ الوطني | الرابط |
| 5. | مركز بحوث العلوم الصحية | الرابط |
| 6. | مركز بحوث العلوم الهندسية | الرابط |
| 7. | مركز بحوث العلوم الأساسية | الرابط
|
| 8. | مركز بحوث علوم الحاسب والمعلومات | الرابط |
بالإضافة إلى هذه المراكز، توفر الجامعة مختبرات بحثية متطورة في مختلف التخصصات، ومكتبات ضخمة تحتوي على ملايين الكتب والمراجع العلمية، وقاعات دراسية مجهزة بأحدث التقنيات التعليمية، مما يدعم البيئة البحثية والأكاديمية للباحثين والطلاب.
