تهدف المعاهد العلمية إلى تحقيق غايات وأهداف سياسة التعليم في المملكة العربية السعودية الصادرة من اللجنة العليا لسياسية التعليم عام 1390هـ المعتمدة بقرار مجلس الوزراء الموقر رقم (779) في 16-17/9/1389هـ ، وبخاصة ما يتعلق بالمرحلتين المتوسطة والثانوية ، إضافة إلى ما نصت عليه سياسة التعليم من أهمية دور المعاهد العلمية وتميزها عن التعليم العام في الباب الخامس ( الفصل الأول ) الذي تضمن أحكام خاصة للمعاهد العلمية في فقراتها التالية :
" 150- تواكب ( المعاهد العلمية ) النهضة التعليمية في البلاد ، وتشارك التعليم العام في مواد الدراسة المناسبة ، وتعنى عناية خاصة بالدراسات الإسلامية واللغة العربية .
151- يؤهل هذا النوع من التعليم الدارسين فيه للتخصصات في علو م الشريعة الإسلامية وفروع اللغة العربية إلى جانب الدراسات في الكليات النظرية الملائمة.
152- يرعى هذا التعليم أبناءه علميا وتربويا وتوجيهيا ومسلكيا لتحقيق أغراضه الأساسية في كفاية البلاد من المتخصصين في الشريعة الإسلامية وعلوم اللغة العربية والدعاة إلى الله " .
مع مراعاة الأهداف العامة لجامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية الجهة المشرفة على المعاهد العلمية، والعمل على تحقيقها.
